Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxrgP28705 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxrgP28705 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms