Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms