Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms