Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Puf60Q3UEB3 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms