Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NfiaQ02780 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms