Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Hoxd13P70217 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms