Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd10P28359 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd10P28359 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd10P28359 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd10P28359 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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Hoxd10P28359 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms