Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC2.59□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC2.59□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC2.59□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC2.58□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC2.58□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC2.58□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms