Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rnft1Q9DCN7 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rnft1Q9DCN7 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rnft1Q9DCN7 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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Rnft1Q9DCN7 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rnft1Q9DCN7 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rnft1Q9DCN7 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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Rnft1Q9DCN7 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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Rnft1Q9DCN7 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
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Rnft1Q9DCN7 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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Rnft1Q9DCN7 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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Rnft1Q9DCN7 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rnft1Q9DCN7 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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