Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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RpainQ9CWY9 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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RpainQ9CWY9 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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RpainQ9CWY9 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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RpainQ9CWY9 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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RpainQ9CWY9 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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RpainQ9CWY9 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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RpainQ9CWY9 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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RpainQ9CWY9 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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