Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ubxn4Q8VCH8 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms