Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp20Q8C6M1 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp20Q8C6M1 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp20Q8C6M1 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp20Q8C6M1 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Usp20Q8C6M1 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Usp20Q8C6M1 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp20Q8C6M1 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms