Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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