Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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Traf3ip1Q149C2 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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Traf3ip1Q149C2 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Traf3ip1Q149C2 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms