Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Pkp1P97350 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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