Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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PtpreP49446 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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