Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Hoxd9P28357 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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