Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxb2P0C1T1 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms