Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms