Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtprtQ99M80 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprtQ99M80 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms