Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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Ddb2Q99J79 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ddb2Q99J79 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Ddb2Q99J79 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ddb2Q99J79 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ddb2Q99J79 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Ddb2Q99J79 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ddb2Q99J79 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ddb2Q99J79 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ddb2Q99J79 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ddb2Q99J79 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ddb2Q99J79 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ddb2Q99J79 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Ddb2Q99J79 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Ddb2Q99J79 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Ddb2Q99J79 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ddb2Q99J79 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Ddb2Q99J79 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Ddb2Q99J79 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Ddb2Q99J79 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Ddb2Q99J79 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Ddb2Q99J79 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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