Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms