Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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Tsr1Q5SWD9 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Tsr1Q5SWD9 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Tsr1Q5SWD9 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Tsr1Q5SWD9 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Tsr1Q5SWD9 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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