Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms