Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Q3U6N9 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms