Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Siah1bQ06985 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms