Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LtbrP50284 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LtbrP50284 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms