Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms