Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp29Q9ES63 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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