Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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