Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrkcaP20444 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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