Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp9yF8VPU6 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms