Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ppargc1bQ8VHJ7 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms