Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms