Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Usp48Q3V0C5 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Usp48Q3V0C5 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Usp48Q3V0C5 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Usp48Q3V0C5 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Usp48Q3V0C5 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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Usp48Q3V0C5 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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