Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sox12Q04890 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sox12Q04890 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms