Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gja5Q01231 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms