Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp1P55194 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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