Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Gm2035J3QP87 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm2035J3QP87 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms