Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp9yF8VPU6 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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