Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Col5a3Q9JLI2 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Col5a3Q9JLI2 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Col5a3Q9JLI2 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Col5a3Q9JLI2 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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