Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Prpf39Q8K2Z2 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Prpf39Q8K2Z2 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prpf39Q8K2Z2 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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