Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm36879-201ENSMUST00000212313 2060 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Trim35Q8C006 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Trim35Q8C006 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Oat-201ENSMUST00000084500 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Trim35Q8C006 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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