Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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Gm28047Q3US59 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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Gm28047Q3US59 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Gm28047Q3US59 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm28047Q3US59 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm28047Q3US59 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm28047Q3US59 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm28047Q3US59 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm28047Q3US59 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm28047Q3US59 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm28047Q3US59 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm28047Q3US59 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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