Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Traf3ip1Q149C2 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Traf3ip1Q149C2 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms