Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxa2P31245 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxa2P31245 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms