Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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