Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer3W4VSP1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms