Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms