Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms